Kann der nachträglich eingebaute Spritfilter (großer Leitungsfilter) das Problem sein?
Das kann sehr gut sein, besonders weil du "großer" sagst...
Ein zusätzlich Filter ist bei der KLEinen eine Streitfrage... Fakt ist, er kann Probleme verursachen wenn die Leitung geknickt wird, oder sich ein Bogen nach oben bildet (wie bei einem Siphon)
Ich habe einen verbaut und bisher seit 15.000 km ohne Probleme 
Wichtig ist, den Benzinfilter möglichst weit UNTEN plazieren (ich hab einen kleinen Benzinfilter ganz unten zwischen den Vergasern) die Benzinleitung muss mit Filter die GLEICHE Länge wie vorher ohne Filter haben.
Zur Sicherheit, von der Luftfilterseite aus, sind jeweils ein "Trichter" Richtung Drosselklappe, hier sind unten die Leerlaufdüsen, die werden gerne mal vergessen (nicht böse sein)
Aber sauber Gas annehmen tut sie noch nicht.
Hmmm, klingt auf jeden Fall nach einem Vergaserproblem bzw. Benzinproblem 
Choke öffnet und schließt wie er soll?
Vergasersynronisation dürfte keine so spürbaren Auswirkungen haben.
Du scheinst ja Schraubererfahrung zu haben, aber zur Sicherheit, frischen Sprit hast du eingefüllt?
Benzinhahn am Tank funktioniert auch wie er soll? du kannst ja mal Versuchsweise auf "PRI" stellen, aber zurückstellen nicht vergessen..
mehr fällt mir im Moment nicht ein